早稲田大学ナノ·ライフ創新研究機構の西嶋傑（にしじますぐる） 次席研究員（現：欧州分子生物学研究所）、理工学術院の木口悠也（きぐちゆうや） 博士課程学生（現: 東京大学）、服部正平（はっとりまさひら） 教授（現：東京大学名誉教授）、東京医科大学消化器内視鏡学分野の永田尚義（ながたなおよし） 准教授、河合隆（かわいたかし）主任教授、国立国際医療研究センター消化器内科の小島康志（こじまやすし） 医長、糖尿病研究センターの植木浩二郎（うえきこうじろう） センター長、感染症制御研究部の秋山徹（あきやまとおる） 特任研究部長、上村直実（うえむらなおみ）国府台病院名誉院長らの研究グループは、Japanese 4D (Disease, Drug, Diet, Daily life) マイクロバイオームコホート1の大規模データを用いた解析から、腸内に生息する膨大な数のバクテリオファージ（細菌に感染するウイルス）を網羅的に同定し、新規ファージグループを発見し、全貌を解明しました。また、腸内ファージコミュニティーに影響を与える宿主・環境因子を多数発見しました。本研究成果は「Nature Communications (IF: 17.7)」に掲載されました（現地時間2022年9月6日（火）公開）。

【本研究のポイント】

• Japanese 4Dマイクロバイオームプロジェクト^１に参加した4,198人を対象に糞便のショットガンメタゲノム解析^２を行い、独自のパイプラインを用いて、4,000以上のバクテリオファージ（ファージ）のゲノム情報を同定しました。
• ヒトの腸内に豊富に存在しているにも関わらず、今まで知られていなかった「未知のファージグループ」を多数発見しました。
• 腸内細菌叢に影響を与える薬剤の種類を詳細に調べ、影響の強さでランキング化したところ、消化器疾患薬や糖尿病薬の影響度が高いことを発見しました。
• 膨大な臨床情報との関連解析により、年齢、性別、食習慣、病気、薬剤摂取などの様々な因子が、腸内のファージコミュニティに影響を及ぼしていることを見出しました。
  
  

　今回の研究結果は、日本人を対象とした大規模ショットガンメタゲノムデータ^２を用いてヒトの腸内に生息するファージコミュニティの全貌を明らかにしたものです。ヒトの腸内に生息するファージは腸内細菌叢^３の形成や機能に大きな影響を与えていると考えられていますが、その多様性や生態系に関する知見は非常に限られており、ヒト腸内における「ダークマター」と呼ばれています。今回、4,198人の被験者を対象とした大規模解析を行うことで、ヒト腸内に生息するファージの全貌が明らかとなり、微生物生態系における細菌とファージの相互作用の理解、さらにはファージによる特定の腸内細菌制御に基づく病気の治療法開発につながることが期待されます。

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